軟件部分主要實現如下功能：鍵盤掃描、LED顯示、A/D溫度數據采集、PWM0/1輸出控制、I2C總線時序模擬、DS1337數據讀寫、RF遙控器信號的外部中斷處理。主程序流程如圖5所示。
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首先單片機上電運行，進行I/O口狀態、DS1337實時時間等的初始化，然后調用LED顯示子程序顯示當前發生器狀態，同時開中斷。接著進行按鍵掃描，有鍵按下則調用按鍵處理程序。如果此時發生器是運行狀態則要進行A/D轉換，檢測發生器內的溫度，如果溫度高于設定值則調節PWM0使風機加速，以降低溫度，在溫度不高于設定值時則減小風機轉速，這樣使溫度始終穩定在最適合臭氧產生的溫度值左右，此外如果溫度高于安全溫度時發生器會蜂鳴報警并關機。執行A/D程序后，單片機會讀取PA4輸入狀態，以判斷定時時間到，時間到，如果是開機狀態(F=1)則關機，如果是關機狀態(F=0)則開機，以實現定時開關機功能，如此反復循環。
在主程序執行過程中，如果外部中斷發生，則轉去中斷處理程序，在中斷程序中，首先關中斷，然后對遙控器信號或者鍵盤信號進行處理，執行相應的按鍵處理程序，再開中斷返回。
