廢水處理工藝的確定是依據廢水水質特性而定的。目前多數水處理公司，對PCB廢水采用分類處理的方法，各公司根據自己的經驗和使用的處理藥劑和設備特點，將PCB生產廢水分類，有的分成三類：即絡合廢水(孔金屬化漂洗水)、非絡合廢水(電鍍、蝕刻、磨板)和脫膜、顯影去油墨漂洗水。有的分作兩類： 即非絡合廢水和絡合廢水。也有將蝕刻廢水歸入絡合廢水處理的，原因是蝕刻廢水中的銅以銅一氨絡合物形態存在的。也有不分類將所有廢水混在一起處理的，混在一起處理所用的沉淀劑為硫化物(Na2S或DTCR)。不論分成兒類或不分類，所使用的辦法多是物理、化學法。即調pH投藥反應、沉淀絮凝分離，或離子交換、活性炭吸附。也有采用常規生物法處理脫膜、顯影廢水的。
化學沉淀主要是去除廢水中的Cu2+、Ni2+，投入的藥劑是NaOH或石灰乳Ca(OH)2， 是用在一定的pH值條件下使之生成氫氧化物沉淀。將孔金屬化漂洗水單獨分離出來，是因為這股水中的Cu2+是以EDTA—Cu的絡合態存在，OH-不能與之發生反應生成Cu(OH)，沉淀，而必須用親合力最強的S2+把EDTA。Cu中的Cu2 奪過來，使之生成CuS沉淀。而蝕刻漂洗水中[Cu(NH3)4]z2+的穩定性與NH 濃度有關，在NH3·H2O濃度高時絡合態占優勢，當NH3·H2O濃度降低時Cu2+占優勢。因此當把蝕刻漂洗水和其他漂洗水混在⋯起時，絡合態的Cu2+向游離態轉變，因此蝕刻漂沈水作為非絡合廢水處理是合理的，不必要分在絡合廢水中。
從理論上講，采用Na，S處理PCB廢水中的重金屬，對Cu2+、Ni2+的去除率更大、更易達標， 且廢水可以混在一起處理，減少許多麻煩。因為Cu(OH)，和Ni(OH)，的溶度積分別為2.8×10-20。和8，7×10-19， CuS和NiS的溶度積分別為8，5×10-45和1.4×10-24。顯然采用Na2s做沉淀劑去除效果更好。但因為S2-也是污染物考核的重要指標，使用Na2s對投入過量的S2-必須用Fe2+進行反沉淀使之從水中去除，多一套加藥裝咒，用含硫的有機螯合物(DTCR)除銅，可生Printed Circuit Information印制電路信息2006 No．8成較人顆粒沉淀，分離較易，DTCR在水中仍以螯合狀仔在，常規的分析方法不易檢出，故不須反沉過量的沉淀劑， 且DTCR沉淀pH范圍較寬，可在中性條件F進行處理，處理后排放水不需再調pH值，減少一道工序，沉淀污泥穩定性好、不分解，污泥填埋后Cu2+不易反析出，環境性、安全性好，但DTCR價格貴，處理成本大，一般使用不普遍，這就是從工藝上仍堅持分類處理的原因所在。
采用離子交換法處理廢水中的重金屬，8O年代初在電鍍廢水處理中使用的比較多，主要是用于Cr6+和Ni2+的去除和回收。但實踐結果離子交換法處理含Cr 廢水可靠性和效果并不佳，運行管理麻煩。回收的鉻酸不符合生產回用要求， 只能作為廢液再處理。故這個方法比較快的被淘汰出局。PCB廢水處理也有采用離子交換處理Cuz 的。80年代香港地區使用此法的較多，離子樹脂是采用大孔徑進口專用性樹脂。西儀環保曾在生意電子(一期)廢水處理中采用過離子交換處理絡和廢水中的銅的工藝。離子交換器(含樹脂)都是通過香港代理商進口的，但設備運行幾天出水就不合格了，樹脂更換后很快又出現故障，不能正常運行，最后廢棄了這套裝置，仍改用硫化物處理。PCB廢水雖然主要的污染種類不多，但成份較復雜，少量的添加劑可能對樹脂產生負作用。
活性炭吸附(或生物活性炭)在PCB廢水處理中，主要是用于去除COD，去除有機物活性炭是很有效的，尤其對于難降解的有機物不失為之重要的手段。但是，活性炭的吸附值是很小的，飽和之后的再生很麻煩，再生設備昂貴，一般使用單位不具備再生手段， 而PCB廢水中的COD一般在1 20mg／L~ 200mg／L，用活性炭柱(或濾池)吸附，對于水量50m3／h以上的處理量，標準炭柱飽和周期在半個月左右，如果增大流速使其迅速通過，控制出水COD≤100mg／L的排方標準，飽和周期可以適當延長，但實踐過程是比較難控制的，采用活性炭吸附去除COD方法可行，但運行成本(活性炭)是比較高的。
有的公司為解決COD問題，把含COD高的廢水單獨分類采用生物法處理， 也有的在處理系統的最后增加曝氣。PCB廢水中的有機物主要是高分子合成物質，屬難降解之類，在處理出水COD達到標準的臨界邊緣時，增加后期曝氣或許能起到彌補作用。目前化工行業中的高濃度難降解有機廢水處理，已培養出一種特殊菌株，在實踐中已獲得較好的效果。筆者認為PCB廢水COD的去除，采用生物法的關鍵同樣是特殊菌的培養和篩選。一旦在菌種培養和篩選上獲得突破，生物法處理PCB廢水就會產生突躍的效果。
對PCB廢水COD的消除，也有采用UV技術的。但由于光催化氧化設備投入高，運行維護費用較多，及處理效果方面的安全性等原因，在國內PCB廢水處理業尚未見實例。目前PCB廢水處理的方法較多，從工藝技術上， 大同小異， 尚未有技術上的重要突破，不同的特點表現在工藝流程設計和設備質量及自控技術水平等方面。
