淀粉企業目前外排的廢水主要來自于玉米浸泡水、玉米輸送洗滌水、蛋白粉分離廢水、水泵冷卻水和地面沖洗水，廢水是含大量淀粉、蛋白質、糖類、脂肪等物質的高濃度有機廢水，如不加以處理直接排入水體中，給環境帶來極大的危害。
玉米浸泡液COD濃度約為8—12萬mg/L，屬高濃度有機廢水，需單獨進行處理。處理方案：上三效蒸發器，濃縮回收玉米漿。其他生產廢水COD濃度約為5000—6000mg/L，需進污水處理設施處理，目前國內淀粉行業廢水治理幾種工藝如下：
1.通過二級厭氧（UASB厭氧反應器）
出水COD≤500 mg/L，適合廢水進污水處理廠的企業。
2. “厭氧+好氧+生物炭深化處理”工藝
出水COD≤150 mg/L適合不進管網但能進流域的企業。山東淀粉企業采用此種工藝，可實現部分水回用。工藝說明：廢水經格柵去除漂浮大塊雜物后，流入調節沉淀池調節水量并使水質均衡，再由泵經熱交換預熱到40-45℃后進入UASB厭氧反應器，靠厭氧微生物的作用，將廢水中的有機物分解為CH4和CO2，產生的沼氣經水封、緩沖罐后送到沼氣利用設施，可回收部分能源。厭氧反應器出水進入缺氧池，經酸化水解后進入組合式生化池，組合式生化池由預曝池、沉淀池和曝氣池組成，預曝池和曝氣池均安裝組合填料，采用曝氣軟管曝氣。廢水首先進入預曝池，預曝氣可以改變厭氧出水的化學特性，提高廢水的氧化還原電位，有利于后續處理單元的運行。廢水經沉淀池進入曝氣池，在好氧條件，依靠填料上附著的微生物將廢水中有機物分解為CO2和H2O，出水經二次沉淀池沉淀后，清水外排。沉淀池的污泥回流到預曝池和曝氣池，以保證組合池中擁有足夠的污泥濃度和生物量，剩余污泥經濃縮罐后進入干化池，經板框壓濾脫水后外運。
3. 厭氧+好氧工藝
工藝說明:淀粉廢水進入調節池，然后經泵進入換熱器升溫，換熱器的熱源采用蒸氣，以便在調試期間對厭氧反應器的進水溫度進行調節控制；廢水加熱到要求溫度后從底部進入厭氧反應器，厭氧反應器控制溫度在35±1℃，在厭氧反應器中厭氧菌群降解廢水中的有機物，將其轉化為沼氣，沼氣依次經水封罐、緩沖罐、流量計計量后送鍋爐燃用；厭氧反應器出水進入沉淀池分離挾帶的污泥后進入曝氣池，在充氧條件下，廢水中的有機物被好氧微生物進一步分解為CO2和H2O；曝氣池出水由二沉池分離挾帶的污泥后，出水滿足標準排放；沉淀池污泥回流至曝氣池，剩余污泥排至污泥干化池，干化后的污泥做農肥；厭氧反應器產生的沼氣依次經水封罐、緩沖罐、流量計計量后送鍋爐燃用。
